¿Cómo funcionan?

En principio igual como cualquier otro buscador, con la diferencia de usar varios motores de búsqueda.
Cada buscador tiene sus bots o spiders que rastrean permanente la red, para actualizar el contenido de sus correspondientes bases de datos en sus servidores. Cuando buscas algo con un buscador, te lista el contenido de esta base de datos que corresponden con tu término de búsqueda.
Un Metabuscador usa los bases de datos de varios buscadores y puede por tanto mostrar también más resultados.
Por ejemplo el buscador SearX, o mejor dicho una instancia de este, ya que no tiene un server propio y por tanto hay que alojar bien en un server propio o usar uno de los instancias públicos alojado por alguien, usa toda una lista de motores de los principales buscadores, que se puede configurar cual o cuales se quiere usar en cada momento

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Lista de instancias públicas que puedes usar, si no tienes un server propio

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