No había visto este subforo, que despistado que soy.
Puedes ser autónomo y trabajador por cuenta ajena a la vez. Cotizas en el régimen general como asalariado y te tienes que dar de alta en el epígrafe del IAE en Hacienda que corresponda como autónomo, en uno empresarial, profesional o artístico, eso dependerá de la actividad que ejerzas.
Así que si se puede hacer perfectamente, digo en España, claro. En otros países no lo sé, supongo que también.