Lo primero que haría, es mirar las rendijas de ventilación, ya que con el tiempo se suele acumular polvo y suciedad que las atascan, impidiendo una buena ventilación que hace que el ventilador causa este ruido, ya que tiene que trabajar más.
En tiendas de fotografía o informática suele haber botes de espray de aire comprimido, con estos y una brocha suave conviene hacer una limpieza del portátil de vez en cuando.